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人類進(jìn)化論
1858年達(dá)爾文提出的學(xué)說
人類進(jìn)化論（evolution）在19世紀(jì)后用于生物學(xué)，專指生物由簡單到復(fù)雜、由低級(jí)到高級(jí)的變化和發(fā)展。又稱演化論。evolution一詞來自拉丁文evolutio，表示展開或把一個(gè)卷緊的卷松開的意思。
基本信息
| 中文名 | 人類進(jìn)化論 |
| 外文名 | evolution |
| 建立時(shí)間 | 1858年7月1日 |
| 創(chuàng)始人 | 達(dá)爾文 華萊士 |
| 相關(guān)著作 | 《物種起源》 |
| 應(yīng)用 |
收起
簡介
“物競天擇，適者生存。”
這是進(jìn)化論最為核心的一句話。
歷史
達(dá)爾文把以前生物變化思想的發(fā)展和關(guān)于萬物互相轉(zhuǎn)化和演變的自然觀可以追溯到人類文明的早期。例如，中國《易經(jīng)》中的陰陽、八卦說，把自然界還原為天、地、雷、風(fēng)、水、火、山、澤八種基本現(xiàn)象，并試圖用“陰陽”、“八卦”來解釋物質(zhì)世界復(fù)雜變化的規(guī)律。古希臘阿那克西曼德（約公元前6世紀(jì)）認(rèn)為生命最初由海中軟泥產(chǎn)生，原始的水生生物經(jīng)過蛻變（類似昆蟲幼蟲的蛻皮）而變?yōu)殛懙厣铩Ｖ惺兰o(jì)的西方，基督教圣經(jīng)把世界萬物描寫成上帝的特殊創(chuàng)造物。這就是所謂特創(chuàng)論。與特創(chuàng)論相伴隨的目的論則認(rèn)為自然界的安排是有目的性的，“貓被創(chuàng)造出來是為了吃老鼠，老鼠被創(chuàng)造出來是為了給貓吃，而整個(gè)自然界創(chuàng)造出來是為了證明造物主的智慧”。
從15世紀(jì)后半葉的文藝復(fù)興到18世紀(jì)，是近代自然科學(xué)形成和發(fā)展的時(shí)期。這個(gè)時(shí)期在科學(xué)界占統(tǒng)治地位的觀點(diǎn)是不變論。當(dāng)時(shí)這種觀點(diǎn)被I.牛頓和C.v林奈表達(dá)為科學(xué)的規(guī)律：地球由于所謂第一推動(dòng)力而運(yùn)轉(zhuǎn)起來，以后就永遠(yuǎn)不變地運(yùn)動(dòng)下去，生物種原來是這樣，現(xiàn)在和將來也是這樣。到了18世紀(jì)下半葉，I.康德的天體論首先在不變論自然觀上打開了第一個(gè)缺口；隨后，轉(zhuǎn)變論的自然觀就在自然科學(xué)各領(lǐng)域中逐漸形成。這個(gè)時(shí)期的一些生物學(xué)家，往往在兩種思想觀點(diǎn)中入門徬徨。例如林奈晚年在其《自然系統(tǒng)》一書中刪去了物種不變的詞句；法國生物學(xué)家G.-L·de布豐雖然把轉(zhuǎn)變論帶進(jìn)了生物學(xué)，但他一生都在轉(zhuǎn)變論和不變論之間徘徊。J.-B·de拉馬克在1809年出版的《動(dòng)物哲學(xué)》一書中詳細(xì)闡述了他的生物轉(zhuǎn)變論觀點(diǎn)，并且始終沒有動(dòng)搖。
18世紀(jì)末～19世紀(jì)后期，大多數(shù)動(dòng)植物學(xué)家都沒有認(rèn)真地研究生物進(jìn)化，而且偏離了古希臘唯物主義傳統(tǒng)，墜入唯心主義。“活力論”雖然承認(rèn)生物種可以轉(zhuǎn)變，但把進(jìn)化原因歸于非物質(zhì)的內(nèi)在力量，認(rèn)為是生物的“內(nèi)部的力量”即活力驅(qū)動(dòng)著生物的進(jìn)化，使之越來越復(fù)雜完善。但活力論缺乏實(shí)際的證據(jù)，是一種唯心的臆測。最有名的活力論者就是法國生物學(xué)家拉馬克。19世紀(jì)后期出現(xiàn)的終極目的論或直生論，認(rèn)為生物進(jìn)化有一個(gè)既定的路線和方向而不論外界環(huán)境如何變化。
①物種是可變的，物種是由變異的個(gè)體組成的群體。
②在自然界的生物中存在著由簡單到復(fù)雜的一系列等級(jí)（階梯），生物本身存在著一種內(nèi)在的“意志力量”驅(qū)動(dòng)著生物由低的等級(jí)向較高的等級(jí)發(fā)展變化。
③生物對環(huán)境有巨大的適應(yīng)能力；環(huán)境的變化會(huì)引起生物的變化，生物會(huì)由此改進(jìn)其適應(yīng)；環(huán)境的多樣化是生物多樣化的根本原因。
學(xué)說
1858年7月1日C.R.達(dá)爾文與A.R.華萊士在倫敦林奈學(xué)會(huì)上宣讀了關(guān)于物種起源的論文。后人稱他們的自然選擇學(xué)說為達(dá)爾文-華萊士學(xué)說。達(dá)爾文在1859年出版的《物種起源》一書中系統(tǒng)地闡述了他的進(jìn)化學(xué)說。其核心自然選擇原理的大意如下：生物都有繁殖過剩的傾向，而生存空間和食物是有限的，所以生物必須“為生存而斗爭”。在同一種群中的個(gè)體存在著變異，那些具有能適應(yīng)環(huán)境的有利變異的個(gè)體將存活下來，并繁殖后代，不具有有利變異的個(gè)體就被淘汰。如果自然條件的變化是有方向的，則在歷史過程中，經(jīng)過長期的自然選擇，微小的變異就得到積累而成為顯著的變異。由此可能導(dǎo)致亞種和新種的形成。
以后發(fā)展
1865年奧地利植物學(xué)家G.J.孟德爾從豌豆的雜交實(shí)驗(yàn)中得出了顆粒遺傳的正確結(jié)論。他證明遺傳物質(zhì)不融合，在繁殖傳代的過程中，可以發(fā)生分離和重新組合。20世紀(jì)初遺傳學(xué)建立，T.H.摩爾根等人進(jìn)而建立了染色體遺傳學(xué)說，全面揭示了遺傳的基本規(guī)律。這本應(yīng)彌補(bǔ)達(dá)爾文學(xué)說的缺陷，有助于進(jìn)化論的發(fā)展；但當(dāng)時(shí)大多數(shù)遺傳學(xué)家（包括摩爾根在內(nèi)），都反對達(dá)爾文的自然選擇學(xué)說。人們對達(dá)爾文進(jìn)化論的信仰，發(fā)生了嚴(yán)重的危機(jī)。
在19世紀(jì)末到20世紀(jì)初這個(gè)時(shí)期出現(xiàn)過一些新的進(jìn)化學(xué)說。荷蘭植物學(xué)家H.德·弗里斯在20世紀(jì)初根據(jù)月見草屬的變異情況提出“物種通過突變而產(chǎn)生”的突變論，而反對漸變論。這個(gè)理論得到當(dāng)時(shí)許多遺傳學(xué)家的支持。某些拉馬克學(xué)說的追隨者們雖然拋棄了拉馬克的內(nèi)在意志概念，但仍強(qiáng)調(diào)后天獲得性遺傳，并認(rèn)為這是進(jìn)化的主要因素。50年代在蘇聯(lián)由T.D.李森科所標(biāo)榜的米丘林學(xué)說，強(qiáng)調(diào)生物在環(huán)境的直接影響下能夠定向變異、獲得性能夠遺傳。所有這些觀點(diǎn)被稱為新拉馬克主義。A.F.L.魏斯曼在1883年用實(shí)驗(yàn)來證明獲得性遺傳的錯(cuò)誤，強(qiáng)調(diào)自然選擇是推動(dòng)生物進(jìn)化的動(dòng)力，他的看法被后人稱為新達(dá)爾文主義。
②現(xiàn)代綜合進(jìn)化學(xué)說。
20世紀(jì)20～30年代首先由R.A.費(fèi)希爾、S.賴特和J.B.S.霍爾丹等人將生物統(tǒng)計(jì)學(xué)與孟德爾的顆粒遺傳理論相結(jié)合，重新解釋了達(dá)爾文的自然選擇學(xué)說，形成了群體遺傳學(xué)。以后C.C.切特韋里科夫、T.多布然斯基、J.赫胥黎、E.邁爾、F.J.阿亞拉、G.L.斯特賓斯、G.G.辛普森和J.W.瓦倫丁等人又根據(jù)染色體遺傳學(xué)說、群體遺傳學(xué)、物種的概念以及古生物學(xué)和分子生物學(xué)的許多學(xué)科知識(shí)，發(fā)展了達(dá)爾文學(xué)說，建立了現(xiàn)代綜合進(jìn)化論。現(xiàn)代綜合進(jìn)化論徹底否定獲得性狀的遺傳，強(qiáng)調(diào)進(jìn)化的漸進(jìn)性，認(rèn)為進(jìn)化是群體而不是個(gè)體的現(xiàn)象，并重新肯定了自然選擇的壓倒一切的重要性，繼承和發(fā)展了達(dá)爾文進(jìn)化學(xué)說。
1968年，日本學(xué)者木村資生根據(jù)分子生物學(xué)的材料提出了分子進(jìn)化中性學(xué)說（簡稱中性學(xué)說）。認(rèn)為在分子水平上，大多數(shù)進(jìn)化改變和物種內(nèi)的大多數(shù)變異，不是由自然選擇引起的，而是通過那些選擇上中性或近乎中性的突變等位基因的隨機(jī)漂變引起的，反對現(xiàn)代綜合進(jìn)化論的自然選擇萬能論觀點(diǎn)（見分子進(jìn)化的中性學(xué)說）。 1972年N.埃爾德雷奇和S.J.古爾德共同提出“間斷平衡”的進(jìn)化模式來解釋古生物進(jìn)化中的明顯的不連續(xù)性和跳躍性，認(rèn)為基于自然選擇作用的種以下的漸進(jìn)進(jìn)化模式，即線系漸變模式，不能解釋種以上的分類單元的起源，反對現(xiàn)代達(dá)爾文主義的唯漸進(jìn)進(jìn)化觀點(diǎn)。爭論仍在繼續(xù)中（見間斷
社會(huì)達(dá)爾文主義：有些人認(rèn)為，應(yīng)該把自然界無情的生存競爭引入人的社會(huì)生活中來。他們認(rèn)為純粹的競爭才能促進(jìn)人類的進(jìn)步，應(yīng)該提倡個(gè)人和國家的競爭（包括終極的毀滅戰(zhàn)爭），從而淘汰失敗者和一些“不適合再生存下去”的一部分人。從而達(dá)到凈化人類基因，優(yōu)化人種的效果。是一種極端思想的體現(xiàn)。是否認(rèn)人的社會(huì)性這個(gè)基本概念，只是贊同“人來源于動(dòng)物”，否認(rèn)“卻高于動(dòng)物”這一人類基本屬性。
小大進(jìn)化
美國遺傳學(xué)家R.B.戈德施米特認(rèn)為，通常的自然選擇，只能在物種的范圍內(nèi)，作用于基因而產(chǎn)生小的進(jìn)化改變，即小進(jìn)化；而由一個(gè)種變?yōu)榱硪粋€(gè)種的進(jìn)化步驟則需要另一種進(jìn)化方式，即大進(jìn)化。他認(rèn)為大進(jìn)化就是通過他所假設(shè)的系統(tǒng)突變（涉及整個(gè)染色體組的遺傳突變）而實(shí)現(xiàn)的。這樣就可以一下子產(chǎn)生出一個(gè)新種甚至一個(gè)新屬或新科。美國古生物學(xué)家辛普森同意把進(jìn)化的研究分成兩大領(lǐng)域：研究種以下的進(jìn)化改變的小進(jìn)化和研究種以上層次的進(jìn)化的大進(jìn)化，但并不同意戈氏的觀點(diǎn)，他并不認(rèn)為小進(jìn)化與大進(jìn)化是各自不同的或彼此無關(guān)的進(jìn)化方式。
小進(jìn)化研究種以下的進(jìn)化改變，包括：①小進(jìn)化的因素和機(jī)制，研究遺傳突變、自然選擇、隨機(jī)現(xiàn)象（如遺傳漂變）等因素如何引起群體的遺傳組成的改變等。②種形成，研究新種的形成方式和過程，研究小進(jìn)化因素如何導(dǎo)致同種的群體之間的隔離的形成和發(fā)展，研究種內(nèi)分化和由亞種、半種到完全的種的發(fā)展過程等。
大進(jìn)化研究種以上的分類單元在地質(zhì)時(shí)間尺度上的進(jìn)化改變，其對象主要是化石，最小研究單位是種。主要研究內(nèi)容包括：①種及種以上分類單元的起源和大進(jìn)化的因素。②進(jìn)化型式，在時(shí)間向度上進(jìn)化的線系的變化和形態(tài)。③進(jìn)化速度，形態(tài)改變的速度和分類單元的產(chǎn)生或絕滅速度，種的壽命等。④進(jìn)化的方向和趨勢。⑤絕滅的規(guī)律、原因及其與進(jìn)化趨勢、速度的關(guān)系等。小進(jìn)化與大進(jìn)化在物種這一層次上相互銜接，事實(shí)上小進(jìn)化與大進(jìn)化都研究物種形成。關(guān)于小進(jìn)化與大進(jìn)化的關(guān)系問題，近年學(xué)術(shù)界展開了激烈的爭論。間斷平衡學(xué)派認(rèn)為不能以小進(jìn)化的機(jī)制來解釋大進(jìn)化的事實(shí)；而現(xiàn)代綜合進(jìn)化論則認(rèn)為小進(jìn)化是大進(jìn)化的基礎(chǔ)，小進(jìn)化的機(jī)制在一定程度上是可以說明大進(jìn)化的現(xiàn)象的。
進(jìn)化型式
從進(jìn)化的觀點(diǎn)看，同時(shí)生存的不同生物種在時(shí)間的向度上可以回溯到一個(gè)共同祖先。因此，按照祖裔關(guān)系可以將現(xiàn)時(shí)生存的和曾經(jīng)生存過的生物相互聯(lián)結(jié)起來，這種表示祖裔關(guān)系的生物進(jìn)化系統(tǒng)稱為種系發(fā)生。生物的種系發(fā)生可以形象地表示為一棵樹：如果從樹根到樹頂代表時(shí)間向度，主干代表共同祖先，大小分枝代表相互關(guān)聯(lián)的進(jìn)化線系，這就構(gòu)成所謂種系發(fā)生樹或進(jìn)化樹。所謂進(jìn)化型式就是進(jìn)化在時(shí)間與空間上的特征，也就是種系發(fā)生的特征，具體表現(xiàn)在進(jìn)化樹的形態(tài)上：枝干的延續(xù)和分枝方式、樹干的傾斜方向和在空間上的配置、樹干的中斷等等，它代表著種系發(fā)生中線系進(jìn)化、種形成、絕滅等方面的特征。
在譜系進(jìn)化中有兩種性質(zhì)不同的進(jìn)化改變。一是形態(tài)結(jié)構(gòu)及其功能由簡單、相對不完善到復(fù)雜和相對完善的前進(jìn)性（進(jìn)步的）改變，稱之為前進(jìn)進(jìn)化；前進(jìn)進(jìn)化的結(jié)果是造成生物的等級(jí)從低級(jí)到高級(jí)。另一種進(jìn)化改變是線系分枝，叫做分枝進(jìn)化；分枝進(jìn)化的結(jié)果是產(chǎn)生新的分類單元和生物歧異度的增長。廣義的前進(jìn)進(jìn)化包括除分枝進(jìn)化以外的各種進(jìn)化改變，既包括前進(jìn)的（進(jìn)步的）進(jìn)化改變，也包括非前進(jìn)的甚至退化的改變。既無前進(jìn)進(jìn)化，又無分枝進(jìn)化的情況稱為停滯進(jìn)化，如活化石之類的情況。
適應(yīng)輻射
在相對較短的地質(zhì)時(shí)間內(nèi)，從一個(gè)線系分枝出許多歧異的分類單元，叫做輻射。由于輻射分枝通常是向不同的方向適應(yīng)進(jìn)化的，所以又稱為適應(yīng)輻射。趨同進(jìn)化與平行進(jìn)化 不同的線系各自獨(dú)立地進(jìn)化出相似的特征叫做趨同進(jìn)化，簡稱趨同。形態(tài)結(jié)構(gòu)的進(jìn)化趨同往往是由于功能的相似，而功能的相似又往往是由于適應(yīng)于相似的環(huán)境。
平行進(jìn)化
（簡稱平行）是指兩個(gè)或多個(gè)有共同祖先的線系，在其祖先遺傳的基礎(chǔ)上分別獨(dú)立進(jìn)化出相似的特征。通常平行與趨同不易區(qū)分，一般說來平行進(jìn)化既涉及同功又涉及同源；假若后裔間的相似程度大于各自的祖先之間的相似程度則可稱為趨同，若后裔之間的相似程度與其祖先之間的相似程度差不多則可稱為平行。大進(jìn)化的模式 ①漸變模式。認(rèn)為形態(tài)進(jìn)化速度多少是恒定的、勻速的，形態(tài)進(jìn)化是逐漸的；形態(tài)改變主要是線系進(jìn)化造成的，大多發(fā)生在種的生存期間，與種形成無關(guān)，種形成（線系分枝）本身只是增加新的進(jìn)化方向。②間斷模式。認(rèn)為形態(tài)進(jìn)化速度是不恒定、非勻速的，快速的“跳躍”與長期的停頓相交替，即在種形成期間進(jìn)化加速，種形成后保持相對的穩(wěn)定。進(jìn)化的形態(tài)改變與種形成相關(guān)聯(lián)，即大部分形態(tài)改變是發(fā)生在相對較短的種形成時(shí)期，在可能長達(dá)數(shù)百萬年的種生存期內(nèi)不會(huì)發(fā)生顯著的形態(tài)改變。兩種模式各有一些有利于自己的證據(jù)，但這些證據(jù)本身還需進(jìn)一步研究才能證實(shí)。
進(jìn)化速率
單位時(shí)間內(nèi)生物進(jìn)化改變量。衡量進(jìn)化速率必須確定兩個(gè)尺度：時(shí)間尺度和進(jìn)化改變量的尺度。時(shí)間尺度有兩種，即絕對地質(zhì)時(shí)間和相對地質(zhì)時(shí)間，一般應(yīng)使用絕對時(shí)間尺度；只在不得已時(shí)，才使用相對時(shí)間尺度。
進(jìn)化趨勢
從長的時(shí)間尺度來看生物進(jìn)化呈某種方向性，但這并非說自然界存在著既定的進(jìn)化軌道，這里說的方向性是統(tǒng)計(jì)學(xué)的趨向。因此，進(jìn)化趨勢是任何因素（包括隨機(jī)的非隨機(jī)的因素）所造成的進(jìn)化的統(tǒng)計(jì)學(xué)趨勢。
小進(jìn)化
小進(jìn)化趨勢是指在生物種的自然群體之內(nèi)，自然選擇作用所造成的表型進(jìn)化改變的趨向性。這種進(jìn)化趨勢通常是適應(yīng)局部環(huán)境的結(jié)果，進(jìn)化改變發(fā)生在線系之內(nèi)，所以也可稱之為線系進(jìn)化趨勢，表現(xiàn)為線系在時(shí)間-進(jìn)化改變坐標(biāo)系內(nèi)的傾斜。
大進(jìn)化
大進(jìn)化趨勢是指在種系發(fā)生中線系分枝的主體的趨向性。大進(jìn)化趨勢發(fā)生在種以上的分類單元的譜系進(jìn)化中，所以又可以稱為譜系進(jìn)化趨勢，表現(xiàn)為譜系中的偏斜。為解釋大進(jìn)化趨勢發(fā)生的原因，不少學(xué)者提出過種種假說，但由于缺乏證據(jù)，能夠成立或有說服力的還很少見。進(jìn)化是生物逐漸演變向前發(fā)展的過程。在這個(gè)過程中，生物由低級(jí)發(fā)展到高級(jí)，由簡單發(fā)展到復(fù)雜。今天地球上的各種生物，極少是和遠(yuǎn)古時(shí)代的祖先一模一樣的。同樣，在未來，各種生物又會(huì)和今天不同，這就是進(jìn)化的結(jié)果。進(jìn)化的過程是極其緩慢的，要經(jīng)過長期的自然選擇逐漸地演化。除了由低等進(jìn)化到高等外，生物的種類也不斷地增多。今天的物種遠(yuǎn)比5億年前的物種多得多，今后還會(huì)不斷地增加。
質(zhì)疑
進(jìn)化論僅僅是一種理論。它既非事實(shí)，也不是科學(xué)定律。許多人在小學(xué)時(shí)就學(xué)過，按等級(jí)劃分的話，理論處于中等——它比純粹的假說有把握，但與定律相比又略遜一籌。然而，科學(xué)家并不是以此劃分這些術(shù)語的。按照美國國家科學(xué)院(NAS)的解釋，科學(xué)理論是「對自然界的某一方面所作的有充分依據(jù)的闡釋，它可以包括事實(shí)、定律、推論以及經(jīng)過檢驗(yàn)的假說等。」定律是有關(guān)自然界的概括性描述，而一種理論無論得到多少證實(shí)，都不會(huì)使它變成定律。因此當(dāng)科學(xué)家們談到進(jìn)化論時(shí)(或者就這個(gè)問題而言，談到原子理論或相對論時(shí))，他們并沒有表示對這一理論的真實(shí)性有任何異議。
除了進(jìn)化的理論之外(所謂進(jìn)化指的是遺傳上的一代勝過一代的概念)，人們也可能舉出進(jìn)化的實(shí)例來。美國科學(xué)院把「事實(shí)」定義為「已經(jīng)獲得反覆證明的、實(shí)際上已被大家公認(rèn)為『真實(shí)』的觀測結(jié)果」。化石記錄和不計(jì)其數(shù)的其他證據(jù)證明了有機(jī)物是隨著時(shí)間的推移而逐步進(jìn)化的。雖然沒有人直接看到這些變化，但間接的證據(jù)既清楚又明確，足以令人信服。無論哪一門科學(xué)，依靠間接證據(jù)來說明問題都是司空見慣的事情。例如，物理學(xué)家不可能直接看到亞原子粒子，因此他們通過觀測粒子在云室中留下的特有軌跡來證明粒子的存在。但物理學(xué)家并沒有因?yàn)闊o法直接觀測而使所得的結(jié)論欠缺說服力。自然選擇陷入了循環(huán)論證的怪圈：適者生存，存者即為適者。
「適者生存」是一種有爭論的自然選擇表述方式，實(shí)際上更專業(yè)的表述方式應(yīng)采用「生存和繁殖分異率」(differential rate of survival and reproduction)這一術(shù)語。這種描述法不是給各個(gè)物種貼上適應(yīng)或不適應(yīng)的標(biāo)簽，而是描述各物種在既定條件下可能留下多少后代。將一對繁殖迅速的小嘴雀科鳴鳥和一對繁殖較慢的大嘴雀科鳴鳥放到一個(gè)食物豐富的島上。在幾代之內(nèi)，繁殖迅速的鳴鳥就可能把持了大部分食物源。但如果大嘴鳴鳥更容易嗑開種子，那么優(yōu)勢就可能轉(zhuǎn)向這些繁殖較慢的鳴鳥一邊。美國普林斯頓大學(xué)的 Peter R. Grant 在對加拉帕戈斯群島上的雀科鳴鳥所做的一項(xiàng)開創(chuàng)性研究中，觀察到了野生條件下種群此消彼長的變化情況。[參看本刊 1992年 2月號(hào)上 Grant所撰的「自然選擇與達(dá)爾文的鳴鳥」一文。] 關(guān)鍵在于，給物種的適應(yīng)性下定義可以不參照其生存能力的強(qiáng)弱：鳥的大嘴更適合嗑開種子，不論這一特性是否在給定條件下具有增強(qiáng)生存能力的價(jià)值。
進(jìn)化是不科學(xué)的，因?yàn)樗炔荒茯?yàn)證，也無法推翻。它的種種論斷所涉及的物種變化都無法觀察到，也永遠(yuǎn)不可能重現(xiàn)。這種全盤否定進(jìn)化論的說法忽視了把進(jìn)化劃分為至少兩大類—微觀進(jìn)化與宏觀進(jìn)化—的若干重要特點(diǎn)。微觀進(jìn)化考察的是物種內(nèi)隨時(shí)間的推移而發(fā)生的變化，這類變化可能是新物種形成的前兆。宏觀進(jìn)化則研究物種這一層次以上的分類學(xué)族群是如何演變的。它的證據(jù)通常來自化石資料以及重構(gòu)各種有機(jī)物之間的關(guān)系而進(jìn)行的 DNA比較。如今連大多數(shù)創(chuàng)世說者都承認(rèn)，實(shí)驗(yàn)室中的試驗(yàn)(如對細(xì)胞、植物和果蠅所作的研究)以及實(shí)地進(jìn)行的考察(如 Grant對加拉帕戈斯鳴鳥嘴部形狀演變所進(jìn)行的考察)都證實(shí)了微觀進(jìn)化的存在。自然選擇及其它機(jī)制(包括染色體改變、共生和雜交等)都可以促使生物群體發(fā)生深刻的變化。宏觀進(jìn)化的歷史性研究所涉及的是根據(jù)化石和 DNA而不是直接觀測作出的推論。但是，對于歷史科學(xué)(包括天文學(xué)、地質(zhì)學(xué)和考古學(xué)和進(jìn)化生物學(xué))，科學(xué)家仍然可以對假說進(jìn)行檢驗(yàn)，看這些假說是否與物理證據(jù)相符，是否能對未來的科學(xué)發(fā)現(xiàn)作出具有檢驗(yàn)性的預(yù)測。例如，進(jìn)化意味著在人類最早的祖先(距今大約 500萬年)以及解剖結(jié)構(gòu)上最早的現(xiàn)代人類(距今約 10萬年)之間，應(yīng)該存在一系列其他原始人，它們身上猿的特點(diǎn)越來越少，而人的特點(diǎn)越來越多，這恰好與化石資料完全吻合。但是我們不會(huì)(也的確沒有)在侏羅紀(jì)(距今約 6500萬年)的地層中找到現(xiàn)代人類的化石。進(jìn)化生物學(xué)的常規(guī)研究作出的預(yù)測比這精細(xì)得多、準(zhǔn)確得多，而且研究人員也不斷對這些預(yù)測進(jìn)行檢驗(yàn)。創(chuàng)世說者也可能通過其他方式來反駁進(jìn)化論。如果能夠找到資料證明哪怕僅僅一種復(fù)雜的生命形式是從無生命物質(zhì)中自發(fā)產(chǎn)生的，那么我們至少在化石中看到的幾種生物可能是通過這種方式進(jìn)化而來的。如果曾有超級(jí)智能外星人出現(xiàn)并創(chuàng)造了地球上的生命(甚至創(chuàng)造了特定的物種)，那么純粹進(jìn)化論的解釋將遭受懷疑。但是迄今沒人提出這類證據(jù)。應(yīng)該指出，把可偽證性當(dāng)作界定科學(xué)的特性這一觀點(diǎn)是哲學(xué)家Karl Popper在 20世紀(jì) 30年代提出來的。因?yàn)樗乃枷霚?zhǔn)則中狹隘的解釋將很多貨真價(jià)實(shí)的科學(xué)研究分支排除在外，直到最近一些年來，他的思想觀點(diǎn)才逐漸被廣義化了。
科學(xué)家越來越懷疑進(jìn)化的真實(shí)性。但沒有證據(jù)表明進(jìn)化論的支持者在逐漸減少。隨便翻開任何一期生物學(xué)的專業(yè)雜志，你都會(huì)找到支持并發(fā)展進(jìn)化論研究或者贊同進(jìn)化是一種根本的科學(xué)概念的文章。與創(chuàng)世說的觀點(diǎn)相反，嚴(yán)肅的科學(xué)雜志更沒有否定進(jìn)化的報(bào)導(dǎo)。上世紀(jì) 90年代中期，美國華盛頓大學(xué)的 George W. Gilchrist 調(diào)查了列入原始文獻(xiàn)的數(shù)千種期刊，想要找到關(guān)于「神力設(shè)計(jì)」或創(chuàng)世說的文章。他查遍了數(shù)十萬個(gè)的科學(xué)報(bào)告，也沒有發(fā)現(xiàn)一篇關(guān)于創(chuàng)世說的報(bào)告。過去兩年中，由東南路易斯大學(xué)的 Barbara Forrest和凱斯西部保留地大學(xué)的 Lawrence M. Krauss分別獨(dú)立進(jìn)行了同樣的調(diào)查，結(jié)果也是無功而返。創(chuàng)世說者則反唇相譏，聲稱思想封閉、頑固排外的科學(xué)界拒不接受他們的證據(jù)。然而，據(jù)《Nature》、《Science》及其他重要雜志的編輯們講，他們幾乎沒有見過有關(guān)反對進(jìn)化論的投稿。有些反對進(jìn)化論的作者曾在嚴(yán)肅的科學(xué)雜志上發(fā)表過論文。但這些論文極少直接攻擊進(jìn)化論，也從不旗幟鮮明地舉出創(chuàng)世說的論點(diǎn)。它們最多不過是指出進(jìn)化論存在某些未解決的問題(這一點(diǎn)并沒有人反對)。簡而言之，創(chuàng)世說者拿不出充足的理由使科學(xué)界能夠認(rèn)真地對待他們的說法。
連進(jìn)化生物學(xué)家彼此間都存在各種分歧，這說明進(jìn)化論所依據(jù)的科學(xué)基礎(chǔ)根本不牢靠。進(jìn)化生物學(xué)家激烈爭論的焦點(diǎn)是各種各樣的。例如，物種是如何形成的、進(jìn)化的快慢、鳥類和恐龍的祖先是否有血緣關(guān)系，尼安德特人是否是不同于現(xiàn)代人的獨(dú)立物種等各種問題。任何一門學(xué)科都難免會(huì)存在這樣那樣的爭論，進(jìn)化論自然也不例外。但是，生物學(xué)界仍然一致接受進(jìn)化論，把進(jìn)化作為生物界中存在的真實(shí)事情和一項(xiàng)指導(dǎo)原則。遺憾的是，虛偽的創(chuàng)世說者總是斷章取義地引用科學(xué)家的話以夸大并曲解他們之間的分歧。
任何一位熟悉哈佛大學(xué)古生物學(xué)家 Stephen Jay Gould著作的人都知道，Gould除了是「間斷平衡模型」(punctuated equilibrium model)的創(chuàng)立人之一外，還是進(jìn)化論最積極的捍衛(wèi)者和宣傳者。(間斷平衡模型認(rèn)為，大多數(shù)進(jìn)化都是在地質(zhì)史上相對短暫的時(shí)期內(nèi)發(fā)生的，這樣就可以解釋我們在化石記錄中所觀察到的現(xiàn)象。不過，地質(zhì)史上的短暫時(shí)期可能也有數(shù)百代之久。)然而，創(chuàng)世說者卻總是不遺余力地從 Gould豐富的著作中斷章取義，使人們以為 Gould曾對進(jìn)化論表示過懷疑。更有甚者將間斷平衡的理論歪曲理解，仿佛間斷平衡會(huì)使新物種在一夜之間就脫穎而出，或者使鳥類從爬行動(dòng)物的卵中產(chǎn)生出來。如果讀者碰到引用科學(xué)權(quán)威人士的話語對進(jìn)化論提出質(zhì)疑時(shí)，一定要結(jié)合上下文來看看這段話究竟是甚么意思。可以肯定，所謂科學(xué)家對進(jìn)化論的攻擊最終被證明是憑空捏造的。
如果人類從猴子演變而來的，那么為何現(xiàn)在還有猴子？這種論據(jù)司空見慣，反映出提問者對進(jìn)化論不同程度的無知。第一個(gè)錯(cuò)誤是進(jìn)化論并沒有告訴我們?nèi)耸呛镒幼儊淼模凰皇钦f人和猴子的祖先相同。此論據(jù)所犯的更深層次錯(cuò)誤與下面這種問法如出一轍：「如果小孩是成年人生的，那為什么還有成年人？」新物種是通過從現(xiàn)有物種中分化出來而實(shí)現(xiàn)進(jìn)化的；當(dāng)某些生物種群與其家族的主要分支隔離開來，并得到充分的變異而使其永遠(yuǎn)成為一個(gè)與原來物種明顯不同的新物種時(shí)，這種分化就產(chǎn)生了。作為母體的物種此后可能無限期地生存下去，當(dāng)然也可能走向滅絕。
進(jìn)化論無法解釋生命最初是如何在地球上出現(xiàn)的。生命的起源在很大程度上仍是一個(gè)不解之謎，但是生物化學(xué)家已經(jīng)弄清楚原始核酸、氨基酸及構(gòu)成生命的其他各種基本元素是如何形成并實(shí)現(xiàn)自我復(fù)制的，從而奠定了細(xì)胞生化過程的基礎(chǔ)。天體化學(xué)分析表明，這類化合物最初可能大量地在太空中形成，然后隨彗星來到地球上。這一理論或許可以解釋，在地球年輕時(shí)的各種條件下，這些生命組成要素是如何出現(xiàn)的。創(chuàng)世說者有時(shí)抓住科學(xué)家當(dāng)前暫時(shí)無法解釋生命的起源這一點(diǎn)大作文章，試圖以此全盤否定進(jìn)化。其實(shí)，即使地球上的生命真的通過進(jìn)化以外的途徑誕生的(如外星人在數(shù)十億年前將首批細(xì)胞帶到了地球上)，不計(jì)其數(shù)的微觀進(jìn)化與宏觀進(jìn)化研究有力地證明了生命的進(jìn)化是一個(gè)確鑿的事實(shí)。
數(shù)學(xué)的分析表明，像蛋白質(zhì)這樣復(fù)雜的東西隨機(jī)產(chǎn)生是不可思議的，更不用說活細(xì)胞乃至人類。機(jī)遇在進(jìn)化中起著一定的作用(例如通過隨機(jī)突變而使物種獲得新的特性)，但進(jìn)化過程并不是靠運(yùn)氣來產(chǎn)生有機(jī)物、蛋白質(zhì)或其他生命實(shí)體的。恰恰相反，自由選擇(應(yīng)為人知的主要進(jìn)化機(jī)制)通過保留「有益的」(適應(yīng)性)特征并淘汰「無益的」(非適應(yīng)性)特征而實(shí)現(xiàn)非隨機(jī)的變化。只要選擇的力度保持穩(wěn)定，自然選擇就可以推動(dòng)進(jìn)化朝著一個(gè)方向前進(jìn)，在出人意料的短期內(nèi)產(chǎn)生出復(fù)雜的結(jié)構(gòu)。我們用這樣的類比打個(gè)比方，將「TOBEORNOTTOBE」這13個(gè)字母組成的序列拿來考慮。假定有100萬只猴子在鍵盤上胡敲亂按，每只猴子每秒鐘打出一個(gè)像上述序列那樣長的字母序，那么它們需要敲擊7.88萬年才可能從 2613 種長度一樣的序列中敲出上面那個(gè)字母序列。然而，到了80年代，美國格倫代爾學(xué)院的Richard Hardison編寫了一個(gè)能隨機(jī)生成短語的計(jì)算機(jī)程序，此程序的特點(diǎn)是，如果單個(gè)字母恰好位于在短語的既定位置上，那么該字母就在這一位置上保持下去(實(shí)際上也就是選擇更接近于哈姆雷特所說的那句話的短語)。該程序平均只需重復(fù)336次，就能再次產(chǎn)生那句短語，所花時(shí)間不到90秒。更令人稱奇的是，該程序甚至可在4天半的時(shí)間里就將莎士比亞的整部劇作重組一遍。
熱力學(xué)第二定律認(rèn)為，隨著時(shí)間的推移，系統(tǒng)必定朝著越來越無序的方向發(fā)展。因此，活細(xì)胞不可能從無生命的化學(xué)物質(zhì)中進(jìn)化出來，而多細(xì)胞生物也不可能從原生動(dòng)物進(jìn)化而來。這種說法錯(cuò)在誤解了熱力學(xué)的第二定律。如果這種說法站得住腳的話，那么礦物晶體和雪花應(yīng)該也屬于不可能成形的物質(zhì)，因?yàn)樗鼈兺瑯邮菑臒o序的組分中形成的復(fù)雜結(jié)構(gòu)。熱力學(xué)第二定律實(shí)際上是說，一個(gè)封閉系統(tǒng)(即不與外界發(fā)生能量和物質(zhì)交換的系統(tǒng))的總熵不會(huì)隨著時(shí)間的推移遞減。熵是一個(gè)物理學(xué)概念，常常被說成是「無序」。然而這個(gè)術(shù)語與慣用的詞還是有很大的差別。更重要的是，熱力學(xué)第二定律允許一個(gè)系統(tǒng)的某部分的熵減少，只要該系統(tǒng)其他部分的熵有相應(yīng)的增加。因此，我們的地球作為一個(gè)整體可能會(huì)變得愈加復(fù)雜，因?yàn)樘柌粩喟褵岷凸馍⑸涞降厍蛏希杻?nèi)部熱核反應(yīng)所導(dǎo)致的熵增大足以抵消散射到地球的熵。簡單的有機(jī)體可以通過耗用其他的生命形式以及非生命物質(zhì)而朝著越來越復(fù)雜的方向發(fā)展。
突變對于進(jìn)化理論來說必不可少。但是突變只能消除特性，而不能產(chǎn)生新的特性。恰恰相反，生物學(xué)資料已經(jīng)證明，許多特性是通過點(diǎn)突變(point mutation)產(chǎn)生的(所謂點(diǎn)突變就是在一種有機(jī)體的 DNA中確切的位置上出現(xiàn)的變化)。細(xì)菌對抗生素的耐受性便是一個(gè)很好的例子。動(dòng)物體內(nèi)調(diào)節(jié)發(fā)育的同源盒結(jié)構(gòu)基因(homeobox)的突變也可以產(chǎn)生復(fù)雜的效應(yīng)。Hox基因決定腿、翼、觸角以及軀體的各部分應(yīng)該在何處長出來。例如，果蠅的觸角足突變(Antennapedia)使在本該長觸角的地方長出了腿。這些異常的肢體不起甚么作用，但是它們的存在證明了遺傳基因出現(xiàn)了錯(cuò)誤，可以產(chǎn)生復(fù)雜的結(jié)構(gòu)，而自然選擇可以借此對這些結(jié)構(gòu)進(jìn)行試驗(yàn)，看其是否有用。此外，分子生物學(xué)研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一些比點(diǎn)突變更高級(jí)的遺傳變化機(jī)制，這些機(jī)制擴(kuò)大了物種新特性出現(xiàn)的途徑。基因內(nèi)的功能分子可以通過各種新穎的方式拼接在一起。整個(gè)的基因也可能意外地在一種有機(jī)物的DNA內(nèi)被復(fù)制，而復(fù)制的基因則可以突變成新的具有復(fù)雜特性的基因。對多種有機(jī)物的 DNA所作的比較表明，血液中的珠蛋白就是以這種方式在數(shù)百萬年中進(jìn)化的。
自然選擇或許能解釋微觀進(jìn)化，但它無法解釋新物種的起源和生命的高級(jí)運(yùn)轉(zhuǎn)規(guī)則。進(jìn)化生物學(xué)家對于自然選擇如何產(chǎn)生新物種已經(jīng)作過廣泛的論述。例如，哈佛大學(xué)的 Ernst Mayr建立了一個(gè)名為「不重疊分布區(qū)」(allopatry)的模型。該模型認(rèn)為，如果通過地理邊界把某一群體的有機(jī)物同其余群體隔絕開來，那么它就可能面臨不同的選擇壓力。被隔絕的群體內(nèi)將逐漸積累起變異的因素。等到這些變異因素積累到相當(dāng)顯著的地步，以致這個(gè)分化出來的群體不可能(或者通常情況下不會(huì))同原始的種群交配而繁殖后代時(shí)，該群體就會(huì)獨(dú)立地進(jìn)行繁殖，并沿著這條道路發(fā)展下去直至最終變成一個(gè)新物種。自然選擇是研究得最為詳盡的一種進(jìn)化機(jī)制，但是生物學(xué)家也同時(shí)考慮了其他各種可能的進(jìn)化機(jī)制。生物學(xué)家一直在評估引起物種形成或產(chǎn)生有機(jī)物復(fù)雜特性的若干不尋常遺傳機(jī)制的潛力。美國阿默斯特馬薩諸塞大學(xué)的 Lynn Margulis及其他研究人員令人信服地證明了某些細(xì)胞器(如產(chǎn)生能源的線粒體)是通過古代有機(jī)體的共生融合而進(jìn)化來的。因此，關(guān)于進(jìn)化可能是由自然選擇以外的其他力量所引起的研究，科學(xué)界表示歡迎。但是這些力量必須源于自然界，而不能歸功于神秘莫測的創(chuàng)世天使的神力作用，因?yàn)檫@類作用的存在根據(jù)沒有得到科學(xué)的證明。
沒有任何人看到過新物種的進(jìn)化過程。物種形成可能是相當(dāng)罕見的，在某些情況下可能要花費(fèi)若干世紀(jì)的時(shí)間。此外，識(shí)別一個(gè)處于形成階段的新物種可能比較困難，因?yàn)樯飳W(xué)家對于如何界定新物種的概念有時(shí)持不同看法。目前應(yīng)用最廣泛的定義是 Mayr 提出的「生物物種概念」(Biological Special Concept)。該定律認(rèn)為，某一物種是由若干獨(dú)立繁殖的群體構(gòu)成的一個(gè)確定種群，也就是通常不會(huì)或不能在其種群以外進(jìn)行繁殖的若干種有機(jī)體。實(shí)際上，這一定義可能很難用于因相距遙遠(yuǎn)或地域不同而彼此隔離的有機(jī)體，也很難用于植物(更不用說無法繁殖的化石)。因此生物學(xué)家通常將有機(jī)物的實(shí)體和行為特性作為其物種歸屬的線索。但是，科學(xué)文獻(xiàn)中的確存在有關(guān)植物、昆蟲及蠕蟲的物種形成報(bào)告。在多數(shù)這類試驗(yàn)中，研究人員把有機(jī)體置于各種各樣的選擇條件下(以解剖差異、交配行為、棲居地喜好以及其他物種特性為選擇對象)，并發(fā)現(xiàn)由此而生成了一些不與外界異族物種進(jìn)行繁殖的有機(jī)體種群。例如，新墨西哥大學(xué)的 William R. Rice和加利福尼亞大學(xué)戴維斯分校的 George W. Salt證明，如果他們根據(jù)果蠅對某種環(huán)境的喜好特性來選擇一組果蠅，并將其單獨(dú)隔離開來繁殖 35代以上，最終所得的結(jié)果是，被隔離的果蠅將拒絕與來自環(huán)境完全不同的果蠅交配。
進(jìn)化論者拿不出任何化石證據(jù)證明有過渡動(dòng)物(如半是爬蟲半是鳥的動(dòng)物)出現(xiàn)過。其實(shí)，古生物學(xué)家早就知曉有關(guān)中間化石(即外形介于各種不同的分類群體之間物種的化石)的許多詳盡實(shí)例。最有名的化石之一是始祖鳥化石(Archaeopteryx)，它既具有鳥類特有的羽毛特征，又具有類似恐龍的骨骼結(jié)構(gòu)特征。研究人員還發(fā)現(xiàn)了大量其他有羽毛的動(dòng)物化石，它們與鳥化石相似的程度，參差不齊。一系列屆的化石完整地描述了現(xiàn)代馬從小型始祖馬(Eohippus)開始的進(jìn)化過程。鯨的祖先是在陸地上爬行的四肢動(dòng)物，而在它們之間的過渡動(dòng)物則是名為 Ambulocetus和 Rodhocetus的兩種兩棲動(dòng)物[參看本刊 2002年第 8期 Kata Wong所著的「征服海洋的哺乳動(dòng)物」一文]。海洋貝殼的化石重現(xiàn)了各種軟體動(dòng)物在千百萬年間的進(jìn)化歷程。大約二十多種人科動(dòng)物(它們并非都是人類的祖先)填補(bǔ)了南方古猿露西(Lucy the australopithecine)和現(xiàn)代人之間的空白。但創(chuàng)世說者卻對這些化石研究成果視而不見。他們聲稱，始祖鳥并不是爬行動(dòng)物和鳥類之間的過渡物種，只不過是一種已經(jīng)滅絕的鳥類，具有某些爬行動(dòng)物的特征罷了。創(chuàng)世說者希望進(jìn)化論者拿出一種匪夷所思、異想天開的怪物，它不能歸入到已知的任何一類種群中。即使創(chuàng)世說者承認(rèn)某一化石是兩類物種之間的過渡生物，他們可能還堅(jiān)持非要看到該化石與后兩類物種之間的其他中間化石不可。這類令人惱火的要求可以一個(gè)接一個(gè)無休止地提出來，而化石記錄始終是不完整的，根本不可能滿足這樣的無理要求。不過，進(jìn)化說者可以從分子生物學(xué)獲得進(jìn)一步的有力證據(jù)。所有有機(jī)體都擁有絕大部分的相同基因，但進(jìn)化論者預(yù)見，這些基因的結(jié)構(gòu)及其產(chǎn)物將根據(jù)各物種之間的進(jìn)化關(guān)系而分異。遺傳學(xué)家所說的「分子時(shí)鐘」將記錄這一時(shí)間進(jìn)程。這些分子數(shù)據(jù)也顯示了各種不同的有機(jī)體在進(jìn)化過程中的過渡關(guān)系。
生物在解剖層次、細(xì)胞層次和分子層次上均有令人驚異的復(fù)雜結(jié)構(gòu)特征；其復(fù)雜性哪怕是只差一點(diǎn)點(diǎn)，它們也將無法正常發(fā)揮其功能，對此唯一可能的結(jié)論就是，生物是神力設(shè)計(jì)而非進(jìn)化的產(chǎn)物。這種所謂的「設(shè)計(jì)論據(jù)」構(gòu)成了最近抨擊進(jìn)化論的核心說法，而且也是創(chuàng)世說者最早使用的論據(jù)之一。1802年，神學(xué)家 William Paley撰文說，如果某人在地里撿到一塊表，那么最合乎情理的推論應(yīng)該是這塊表是有人掉在地里的，而不是靠自然力量形成的。Paley聲稱，由此推知，生物的復(fù)雜結(jié)構(gòu)必定也是直接的神力所為。達(dá)爾文寫了《物種起源》一書來反駁 Paley。該書闡述了作用于遺傳特征的自然選擇力量如何逐步地完善復(fù)雜的有機(jī)體結(jié)構(gòu)的進(jìn)化過程。一化又一代的創(chuàng)世說者以眼睛是一種可能靠進(jìn)化而形成的結(jié)構(gòu)來試圖駁倒達(dá)爾文的觀點(diǎn)。他們認(rèn)為，眼睛之所以能產(chǎn)生視覺，全憑其各組成部分之間天衣無縫的組合。因此自然選擇不可能傾向于眼睛進(jìn)化過程中所需要的過渡結(jié)構(gòu)(試問半只眼睛有甚么用呢？)。達(dá)爾文似乎對創(chuàng)世說者的這種詰難有先見之明，他指出，即使是「不完整」的眼睛也可能有它的好處(如幫助動(dòng)物轉(zhuǎn)向有光的方向)，因此可以被遺傳下來以待進(jìn)化過程對其作出進(jìn)一步的改良。生物學(xué)證實(shí)了達(dá)爾文的分析：研究人員在整個(gè)動(dòng)物王國中都可鑒定出原始的眼睛和感光器官，甚至還通過比較遺傳學(xué)研究勾畫出了眼的進(jìn)化史。(現(xiàn)在看來，在不同的有機(jī)體家族中，眼睛是獨(dú)立進(jìn)化的。) 如今鼓吹神力設(shè)計(jì)的人比其老前輩更加老練，但其論據(jù)和目標(biāo)仍是萬變不離其宗。為了駁倒進(jìn)化論，他們企圖證明進(jìn)化論不可能解釋我們所知道的生命，進(jìn)而堅(jiān)持認(rèn)為，唯一站得住腳的替代理論就是，生命是靠一種高深莫測的神力創(chuàng)造出來的。
新近的發(fā)現(xiàn)證明，即使在微觀層次上，生命也具有某種不可能通過進(jìn)化產(chǎn)生的復(fù)雜性。 「不可簡化的復(fù)雜性」是《達(dá)爾文的黑盒子：進(jìn)化論面臨的生化挑戰(zhàn)》一書的作者，列哈依大學(xué)的 Michael J. Behe提出的口號(hào)。Behe以捕鼠夾作為「不可簡化的復(fù)雜性」的一個(gè)通俗例子。捕鼠夾這種器具的特點(diǎn)是，只要有任何零件丟失，它便不起任何作用，而且它的各個(gè)零件只有作為一個(gè)整體的組成部分才有價(jià)值。Behe宣稱，如果說捕鼠夾如此，那么細(xì)菌的鞭毛就更是如此(鞭毛是一種起推進(jìn)作用的鞭狀細(xì)胞器，其功能猶如船舶的舷外發(fā)動(dòng)機(jī))。構(gòu)成鞭毛的蛋白質(zhì)如鬼斧神工般巧妙地排列成發(fā)動(dòng)機(jī)的部件、方向舵以及工程師可能要求采用的其他種種結(jié)構(gòu)。Behe聲稱，這樣復(fù)雜巧妙的布局通過進(jìn)化上的改良而設(shè)計(jì)出來的可能性實(shí)際上等于零，因此證明了它只能是神力表演的絕技。他對于凝血機(jī)制以及其他分子系統(tǒng)也表述了類似的觀點(diǎn)。然而進(jìn)化生物學(xué)家已經(jīng)反駁了這類看法。首先，有些鞭毛的構(gòu)形比 Behe所提到的鞭毛簡單，因此一種鞭毛并不一定需要上述所有組成部分均齊備才能發(fā)揮作用。Behe所提到的鞭毛其較高級(jí)的組成部分全都可以在自然界的其他地方找到先例，布朗大學(xué)的 Kenneth R. Miller及其他研究人員對此已有論述。實(shí)際上，整個(gè)鞭毛系統(tǒng)與一種名為 Yersinia pestis的細(xì)胞器極其相似(鼠疫細(xì)菌利用這種細(xì)胞器將毒素注射進(jìn)細(xì)胞中)。關(guān)鍵在于，盡管 Behe聲稱鞭毛的各組成系統(tǒng)除了用于推進(jìn)作用以外沒有其他任何價(jià)值，但實(shí)際上這些系統(tǒng)可能具有多種功能，從而有利于鞭毛的進(jìn)化。因此鞭毛的最終進(jìn)化過程可能僅僅是通過某種新穎的方式把原先為其他用途進(jìn)化出來的復(fù)雜組成部分重新組合起來。加利福尼亞大學(xué)圣迭戈分校的 Russell F. Doolittle所做的研究表明，凝血系統(tǒng)看來是通過改良并完善了最初用于消化的蛋白質(zhì)而進(jìn)化的，這與鞭毛的進(jìn)化有異曲同工之妙。所以，Behe用來作為神力設(shè)計(jì)證據(jù)的「不可簡化的復(fù)雜性」并非真的不可簡化。
另一類復(fù)雜性—所謂「特定復(fù)雜性」(specified complexity)—是貝樂大學(xué)的 William A. Dembski在其著作《設(shè)計(jì)推理》和《沒有免費(fèi)的午餐》中提出的神力設(shè)計(jì)論據(jù)的核心。他的論據(jù)實(shí)質(zhì)上是說，生物的復(fù)雜性是任何盲目的、隨機(jī)的過程永遠(yuǎn)無法產(chǎn)生的。Dembski聲稱，唯一合乎邏輯的結(jié)論是某位超人的神靈創(chuàng)造了生命并左右其發(fā)展，這一說法與 Paley 200年前的論斷如出一轍。Dembski的論據(jù)有若干漏洞。他暗示對生物進(jìn)化的解釋只是隨機(jī)產(chǎn)生或神靈設(shè)計(jì)，這是不正確的。在圣菲研究所和其他地方研究非線性系統(tǒng)與元胞自動(dòng)機(jī)(cellularautomata)的研究人員已經(jīng)證明，簡單的無向過程能夠產(chǎn)生極其復(fù)雜的模式。因此，有機(jī)體中所呈現(xiàn)的某些復(fù)雜性從一定程度上講，可能是通過我們幾乎還不了解的自然現(xiàn)象產(chǎn)生的。然而這完全不等于說生物的復(fù)雜性不可能自然地產(chǎn)生。
創(chuàng)世說
「創(chuàng)世科學(xué)」的提法本身就是自相矛盾。現(xiàn)代科學(xué)的核心原則就是方法論的自然主義，即力求通過觀測到的或可檢驗(yàn)的自然機(jī)制來解釋宇宙。物理學(xué)用支配物質(zhì)與能量的特定概念來描述原子核，并通過實(shí)驗(yàn)對這些描述進(jìn)行檢驗(yàn)。只有當(dāng)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示先前的描述不足以解釋觀測到的現(xiàn)象時(shí)，物理學(xué)家才會(huì)引入新的粒子(如夸克)來豐富其理論。而且，這些新粒子的特性并不能隨便定義(新粒子的界定受到嚴(yán)格的約束，因?yàn)樗鼈儽仨毮芗{入到現(xiàn)有的物理學(xué)框架中)。相反，鼓吹神力設(shè)計(jì)的理論家則搬出各種虛幻莫測的東西，并隨意賦予它們以不受約束的各種能力—總之是，怎樣能解答當(dāng)前的問題就怎樣說。這樣的答案非但不能促進(jìn)科學(xué)探索，反而會(huì)阻擋科學(xué)探索的道路(如，如何否定萬能神靈的存在？)。神力設(shè)計(jì)說不能解決任何問題。例如，具有設(shè)計(jì)能力的神靈是何時(shí)介入生命史的？又是怎樣介入的？是通過創(chuàng)造第一個(gè) DNA，第一個(gè)細(xì)胞，還是第一個(gè)人？每一物種都是神力設(shè)計(jì)的嗎？抑或只有少數(shù)早期物種是神力設(shè)計(jì)的？鼓吹神力設(shè)計(jì)說的人常常回避這些問題。他們關(guān)于神力設(shè)計(jì)的說法常常是五花八門，迥然不同，他們也甚至懶得去互相溝通一下以自圓其說。他們采用排除法來進(jìn)行論證，也就是極力貶低進(jìn)化論的解釋，將其斥為牽強(qiáng)附會(huì)或不完整的理論，從而間示只有以神力設(shè)計(jì)為基礎(chǔ)的替代理論者是站得住腳的。從邏輯上講，設(shè)計(jì)說的鼓吹者完全是在誤導(dǎo)人：即使某種自然主義的解釋有問題，也并不意味著所有這類解釋都應(yīng)該一棍子打死。此外，他們的論述也沒有使任意一種神力設(shè)計(jì)說顯得比另一種更合理，實(shí)際上就是讓聽眾們自己去作判斷，而某些聽眾在進(jìn)行這類判斷時(shí)無疑會(huì)用宗教信仰去取代科學(xué)概念。科學(xué)研究一次又一次地證明方法論的自然主義可以克服無知，為那些一度看來深不可測的難解之謎找到越來越詳盡、合理的答案。有關(guān)光的本性、疾病的起源以及腦的機(jī)理等問題均是如此。現(xiàn)在進(jìn)化論正在為破解生命如何形成和發(fā)展之謎做著同樣的工作。創(chuàng)世說無論以何種名義作掩飾，都不會(huì)為這方面的科學(xué)研究增添絲毫有價(jià)值的東西。
泛進(jìn)化論
現(xiàn)有生物學(xué)進(jìn)化理論和神學(xué)創(chuàng)造論存在致命的局限：1）整個(gè)宇宙從奇點(diǎn)大爆炸開始就開始演變，從場到粒子、星球、星系、分子的形成，從原始人類社會(huì)到現(xiàn)代人類文明，從簡單技術(shù)發(fā)明到現(xiàn)代高科技，無凝是一個(gè)演變發(fā)展的進(jìn)化過程，一個(gè)生態(tài)系統(tǒng)的形成也是從低級(jí)到高級(jí)、從少到多的物種發(fā)展過程，因而生物界也必然是一個(gè)從低級(jí)到高級(jí)、從相同到不同的許多生物物種的進(jìn)化；2）神學(xué)創(chuàng)造論并沒有解釋任何科學(xué)家感興趣的生物物種形成的具體內(nèi)容，對知識(shí)的增加沒有提供可發(fā)展的前景，對生物的研究和認(rèn)識(shí)沒有可操作的方法論，不能對不同等級(jí)不同類型的多樣性生物之間的具體關(guān)系提供知識(shí)。3）現(xiàn)有進(jìn)化理論只能解釋生物界是進(jìn)化和演變而來，而且是自然和人工對遺傳變異的選擇；但是不能解釋遺傳變異的規(guī)模性與必然性，也不能解釋物種之間的超越性大型遺傳演變。中國科學(xué)家曾（杰）邦哲（Zeng BJ）1986年著述、1994年修訂了《結(jié)構(gòu)論 - 泛進(jìn)化論》，發(fā)表于1991年-1997年，并闡述了系統(tǒng)生物科學(xué)與工程、系統(tǒng)醫(yī)藥學(xué)的概念：1）生物界的演變包括兩個(gè)方面，即生物體結(jié)構(gòu)的進(jìn)化和生物體形態(tài)的適應(yīng)，以往進(jìn)化論沒有闡明兩者的關(guān)系與區(qū)別；2）生物界的遺傳變異也包括兩個(gè)方面：A）生物物種基因組內(nèi)等位基因的替代、等位基因突變形成等位基因庫，以及非等位基因間排列組合的變化、染色體的畸變，B）生物物種基因組內(nèi)基因種類和數(shù)量的增加、不在以往的基因范圍內(nèi)，新的基因群體的形成；3）生物物種基因組內(nèi)基因的自組織化與程序化表達(dá)構(gòu)成生物的進(jìn)化與發(fā)育兩個(gè)方面，基因劃分為控制一個(gè)相對獨(dú)立性狀的基因群（genes group)、發(fā)育過程前后誘導(dǎo)表達(dá)的系列基因鏈（genes chain）和物種之間基因同源變異的基因家族（genes family)；4）生命現(xiàn)象不是一個(gè)物質(zhì)和能量的概念，還是一個(gè)自組織化的信息概念，生物遺傳進(jìn)化是信息的增長，生物體形體發(fā)生也是信息的展示過程，生物的物質(zhì)不斷更換、能量不斷地流動(dòng)，生命活動(dòng)是一個(gè)信息控制過程；5）生物體不是一個(gè)單靠分解方法可以理解的復(fù)雜系統(tǒng)，而且是從分子、細(xì)胞、器官、個(gè)體、群體、生態(tài)的多層次復(fù)雜系統(tǒng)，研究生命科學(xué)必然從傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)方法論走向系統(tǒng)科學(xué)的分析與整合滲透的方法論；6）生物系統(tǒng)發(fā)生演變的邏輯學(xué)是系統(tǒng)邏輯或結(jié)構(gòu)邏輯，計(jì)算機(jī)科學(xué)、系統(tǒng)科學(xué)本身最初從生理學(xué)的體液穩(wěn)態(tài)機(jī)理、神經(jīng)反饋和動(dòng)物與機(jī)器的通信行為的研究中誕生，分維幾何探討了生物體比如植物樹枝與整個(gè)植物的同形全息性等，因此系統(tǒng)科學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、生物材料納米技術(shù)與生物科學(xué)、生物醫(yī)學(xué)等必然走向整合，并將帶來未來的智能機(jī)器人、工程生物體人工進(jìn)化的系統(tǒng)生物工程與系統(tǒng)醫(yī)藥學(xué)。因此，提出了整個(gè)自然生物系統(tǒng)與人工生物系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)、功能與演變相互關(guān)系的泛進(jìn)化理論，以及遺傳學(xué)從經(jīng)典遺傳學(xué)、分子遺傳學(xué)發(fā)展到系統(tǒng)（結(jié)構(gòu)-圖式）遺傳學(xué)（system genetics/pattern genetics, 參考1994-1996年《轉(zhuǎn)基因動(dòng)物通訊》和2003澳大利亞《第19屆國際遺傳學(xué)大會(huì)論文集》等）的概念與方法。
人類進(jìn)化
1>未來人類將走上衰亡之路（著名的英國古生物學(xué)家狄克森認(rèn)為，未來的人類將走上衰亡之路。因?yàn)閺纳飳W(xué)的觀點(diǎn)來看，自然死亡是一種正常的優(yōu)勝劣汰，會(huì)除去人類基因庫中各種致病的壞基因。但在今天，由于醫(yī)學(xué)的發(fā)展，使有病的人都能得到治療，都能生兒育女，這樣，這些人就會(huì)把體內(nèi)的致病基因遺傳下去，結(jié)果，人類積累的壞基因數(shù)目一代比一代多，導(dǎo)致人人都帶有大量致病基因，因而體質(zhì)越來越差）
2>未來人變成大腦袋小身體的模樣.(加拿大人類學(xué)家瑟爾和塞格京提出了“直線進(jìn)化理論”，認(rèn)為人類將越來越強(qiáng)大。他們認(rèn)為，50萬年以后，隨著人類對腦力的依賴性大大超過體力，未來人的大腦體積將遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于我們現(xiàn)在的大腦體積，而肢體卻漸漸退化萎縮，最后變成大腦袋`小身體的模樣~）
3>未來人在身體結(jié)構(gòu)比例上和今天的人差別不大（還有一種觀點(diǎn)就是人類的“穩(wěn)定進(jìn)化理論”。這種理論認(rèn)為，與其他動(dòng)物進(jìn)化相似，人類的進(jìn)化也不會(huì)沿著直線發(fā)展，因此不能以單純的形體改變或大腦的變化來作為人類進(jìn)化的標(biāo)志。未來人身體結(jié)構(gòu)比例上，和今天的人不會(huì)有多大差別，但未來人的聰明才智肯定得到了高度的發(fā)展。）
發(fā)展方向
上面一段說的有點(diǎn)兒矛盾，無可質(zhì)疑，人類一直是在進(jìn)步。無論是智力還是身體，無論是大腦重量還是體重身高等等，在短時(shí)期內(nèi)當(dāng)然是不斷前進(jìn)發(fā)展的。（我國人均身高體重和壽命與建國前甚至明清時(shí)明顯增加）
要說人類衰退嗎，我也同意，而且發(fā)展的方向是腦子和體重身高都會(huì)減少/降低，智慧和體力都會(huì)下降（不少）
但這不是近期的事情，而是站在一個(gè)比較高的山頭看。
參考資料
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達(dá)爾文的“進(jìn)化論”如何導(dǎo)向叢林法則？2019-10-04T11:55:31+08:00[引用日期2022-05-19 11:35:14]
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蓋亞假說：地球是一個(gè)生命體嗎？2021-01-05T07:47:35+08:00[引用日期2022-05-19 12:01:50]
[3]
“人類世”“熵世”與“末世”2021-12-21T07:33:53+08:00[引用日期2022-05-19 12:02:11]
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【biological_special_concept】什么意思_英語biological_spec[引用日期2022-05-19 12:02:22]
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從作戰(zhàn)體系升級(jí)談“智勝”機(jī)理:體系進(jìn)化快者勝-新華網(wǎng)2021-12-16T14:51:55+08:00[引用日期2022-05-23 18:25:17]
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